No dia 17 de outubro, a Transparência Internacional rebateu as críticas proferidas pelo ministro do Supremo Tribunal Federal, Gilmar Mendes, que a chamou de cúmplice da força-tarefa da Lava Jato. Mendes fez suas declarações durante uma sessão plenária em 15 de outubro, referindo-se à organização como responsável por abusos no sistema de justiça criminal brasileiro.
A Transparência Internacional expressou sua profunda preocupação com as alegações do ministro, que considera infundadas. A nota da organização afirma que todas as acusações relacionadas ao gerenciamento de recursos de acordos de leniência no Brasil foram repetidamente refutadas. Além disso, a entidade critica a falta de oportunidade para defesa, considerando as declarações de Mendes incompatíveis com o decoro judicial.
Por fim, a Transparência Internacional alertou que as acusações feitas por Mendes promovem desinformação sobre seu trabalho. A organização destacou a gravidade da situação, considerando estarrecedora a origem das críticas, que vêm de um membro da Corte, conhecido por sua atuação no combate à desinformação. Este embate ressalta as tensões entre instituições de justiça e organizações da sociedade civil no Brasil.