Após a eleição da Mesa do Senado, a atenção agora se volta para a composição e presidência das 16 comissões permanentes da Casa. Líderes partidários começaram a anunciar os nomes que devem assumir a presidência de algumas dessas comissões, com destaque para o MDB, que comandará várias delas, incluindo a Comissão de Assuntos Econômicos e a Comissão de Assuntos Sociais. A Comissão Mista de Mudanças Climáticas também ficará sob o controle do partido, embora o nome do indicado ainda não tenha sido revelado.
O Republicanos e o PL também definiram suas escolhas, com destaque para a indicação de Damares Alves para presidir a Comissão de Direitos Humanos e de Flávio Bolsonaro para a Comissão de Segurança Pública. Bolsonaro, por sua vez, afirmou que seu foco será aumentar as penas para crimes violentos e revisar a legislação penal, enquanto o PL tem outro nome para presidir a Comissão de Infraestrutura. A oposição, segundo alguns líderes, terá maior visibilidade com essas escolhas, fortalecendo seu papel no Senado.
Além dessas comissões, outras lideranças também se destacaram, como a possível presidência de Nelsinho Trad na Comissão de Relações Exteriores e a de Otto Alencar na Comissão de Constituição e Justiça. O processo para a instalação das comissões e a eleição de seus presidentes e vice-presidentes seguirá as normas do Regimento Interno do Senado, com votação secreta e critérios para desempate, incluindo a eleição do parlamentar mais idoso em caso de novos empates.
