O Sistema de Seleção Unificada (Sisu) 2025 enfrentou uma série de problemas, incluindo atrasos na divulgação dos resultados, que deveriam ter sido publicados no domingo (26), mas foram disponibilizados apenas na segunda-feira (27). Além disso, o Ministério da Educação (MEC) não havia enviado até a terça-feira (28) as listas de aprovados para várias universidades, o que causou a alteração no calendário de matrículas de diversas instituições. O MEC estendeu o prazo da etapa até 3 de fevereiro, prometendo que essa mudança não afetaria o calendário acadêmico das universidades.
Candidatos e universidades enfrentaram dificuldades com o sistema de divulgação dos resultados, que estava desorganizado e não fornecia informações claras sobre a classificação na lista de espera. A ausência de dados cruciais dificultou a tomada de decisão dos estudantes, que não conseguiam determinar sua posição para novas vagas ou se seria vantajoso optar por uma segunda chamada. A falta de transparência gerou frustração entre os candidatos, que reclamaram da confusão nas informações e da demora nos processos.
A Associação Nacional dos Dirigentes das Instituições Federais de Ensino (Andifes) indicou que as universidades estão adaptando seus calendários de matrícula devido aos problemas enfrentados pelo Sisu, resultando em um cenário de incerteza tanto para os estudantes quanto para as instituições. O MEC, por sua vez, não esclareceu completamente os erros no sistema de divulgação, limitando-se a explicar que as informações haviam sido publicadas.